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https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/11605| Título : | Diversidad microbiana (procariota y eucariota) asociada a Mantos de Sargassum Pelágico y agua circundante en el Mar Caribe. |
| Autor : | Vera Goyeneche, Edwin Martin. |
| Palabras clave : | El autor no proporciona la información sobre este ítem. |
| Fecha de publicación : | 2024 |
| Editorial : | Universidad de Pamplona - Facultad de Ciencias Básicas. |
| Citación : | Vera Goyeneche, E. M. (2024). Diversidad microbiana (procariota y eucariota) asociada a Mantos de Sargassum Pelágico y agua circundante en el Mar Caribe. [Trabajo de Grado Pregrado, Universidad de Pamplona]. Repositorio Hulago Universidad de Pamplona. https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/11605 |
| Resumen : | Holopelagic species of the genus Sargassum (S. fluitans and S. natans; also known as Sargassum) have been massively landing on the Caribbean coasts since 2011, causing multiple problems. However, these brown algae also play an important role in aquatic ecosystems; they provide food and shelter to a large number of marine organisms, many of which are associated with their mantles.One of the associations that stands out is that of bacteria and other microorganisms. Considering the above, this exploratory study estimated the diversity of bacterioplankton and eukaryotic microorganisms associated with pelagic Sargassum and surrounding water, taking and comparing variables such as location or sampling area, time and type of sample. Using the 16S rDNA libraries of data collected in the Puerto Morelos reef system in the Mexican Caribbean by the InvaSAR project working group, we estimated the diversity indices of Shannon, Simpson, InvSimpson, observed ASVs, and complementary analyses such as PCoA, LEFsE, and PERMANOVA, all supported by the use of tools such as R studio and Galaxy HubLab. Prior to this, all ASVs were filtered to obtain the plastid ASVs of eukaryotic microorganisms that were aligned and assigned using the BLAST + software and the NCBI database. Significant differences were found for the microbial communities of bacterioplankton and eukaryotic microorganisms between the type of samples (Sargassum and water) and only for bacterioplankton between the sampling times. Alphaproteobacteria was the most abundant group in water samples and Gammaproteobacteria in Sargassum samples, with an enrichment of Vibrio. |
| Descripción : | Las especies holopelágicas del género Sargassum (S. fluitans y S. natans; también conocidos como sargazo), están recalando desde 2011 de forma masiva a las costas del Caribe causando múltiples problemas. Sin embargo, estas algas pardas desempeñan de igual manera un papel importante en los ecosistemas acuáticos; proporcionan alimento y refugio a una gran cantidad de organismos marinos, muchos de los cuales se encuentran asociados a sus mantos. Una de las asociaciones que se destaca es la establecida de bacterias y otros microorganismos.Considerando lo anterior, en este estudio exploratorio se estimó la diversidad del bacterioplancton y microorganismos eucariotas asociados a sargazo pelágico y agua de mar circundante, tomando y comparando variables como la ubicación o zona de muestreo, el tiempo y tipo de muestra. Haciendo uso de las bibliotecas de 16S rADN de datos colectados en el sistema arrecifal de Puerto Morelos en el Caribe mexicano por parte del grupo de trabajo del proyecto InvaSAR se estimaron los índices de diversidad de Shannon, Simpson, InvSimpson, ASVs observados, y análisis complementarios como PCoA, LEFsE, y PERMANOVA. Todo apoyado del uso de herramientas de trabajo como R studio y Galaxy HubLab. Previo a esto todos los ASVs se filtraron para obtener los ASVs plastidicos de microorganismos eucariontes que fueron alineados y asignados haciendo uso del software BLAST + y la base de datos de NCBI. Se encontraron diferencias significativas para las comunidades microbianas de bacterioplancton y microorganismos eucariotas entre el tipo de muestras (sargazo y agua) y solo para bacterioplancton entre los tiempos de muestreo. Alphaproteobacteria fue el grupo más abundante en muestras de agua y Gammaproteobacteria en muestras de sargazo, con un enriquecimiento de Vibrio. |
| URI : | https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/11605 |
| Aparece en las colecciones: | Biología |
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