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Title: Evaluación in silico de los parámetros termodinámicos del complejo activado en reacciones ion-molécula y molécula-radical en el medio interestelar en un rango de (20 a 300) K.
Authors: Rodríguez López, Yeison Felipe.
Keywords: Química computacional.
Energía libre de activación.
Estados de transición.
Medio interestelar.
Temperatura.
Reacciones de gases.
Issue Date: 2024
Publisher: Universidad de Pamplona - Facultad de Ciencias Básicas.
Citation: Rodríguez López, Y. F. (2024). Evaluación in silico de los parámetros termodinámicos del complejo activado en reacciones ion-molécula y molécula-radical en el medio interestelar en un rango de (20 a 300) K. [Trabajo de Grado Pregrado, Universidad de Pamplona]. Repositorio Hulago Universidad de Pamplona. https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/12176
Abstract: In this work, computational chemistry has been employed to study the formation of 2 molecules with prebiotic character in the interstellar medium (CD3 , CH3 , c-C3H2O). The search focuses on identifying reactions with the necessary characteristics for the formation of cyclopropenone and methyl free radical in the Sgr B2 molecular cloud. For this purpose, the principle of spontaneity and theoretical background were applied, which allowed reducing an initial set of 11 possible reactions to a subset of 5 chemical routes. Work was conducted using the Gaussian 09 program, applying collision theory, transition state theory (TST), molecular orbital theory, and density functional theory (DFT). Within the applied methodology, the M05-2X method and the 6-31+G* basis set were used. Through molecular study and optimization, structural properties (bond lengths and bond angles), free energies, enthalpies, and activation free energies were determined. Additionally, rate constants were calculated at temperatures from 20 to 300 K, along with tunnel effect and Eckhart potential for 3 of the 5 proposed reactions, finding activation energies of 21.778 kcal/mol for reaction 1: c-C3H2 + O2 -C3H2O + O, and rate constants for reaction 4: CH4 + OH -> CH3 + H2 -C3H2 + OH c-C3HOH + H, three transition states leading to the c-C3HOH isomer were calculated. The presented results are consistent with experimental and theoretical studies of the systems studied.
Description: En este trabajo, se ha empleado la rama de la química computacional para estudiar la formación de 3 moléculas en el medio interestelar con carácter prebiótico (CD3 , CH3 , c- C3H2O). La búsqueda se centra en identificar reacciones con las características necesarias para la formación de ciclopropenona y radical libre metilo en la nube molecular Sgr B2. Para ello, se aplicó el principio de espontaneidad y antecedentes teóricos, lo cual permitió reducir un conjunto inicial de 11 reacciones posibles a un subconjunto de 5 rutas químicas. Se trabajó con el programa Gaussian 09, aplicando la teoría del estado de transición (TST), la teoría de orbitales moleculares y la teoría del funcional de la densidad (DFT). Dentro de la metodología aplicada, se utilizó el funcional M05-2X y el conjunto de funciones base 6- 31+G*. Realizando así un estudio y optimización de las moléculas, se determinaron sus propiedades estructurales (longitudes de los enlaces y ángulos de enlace), energías libres, entalpías y energías libres de activación. Asimismo, se calcularon las constantes de velocidad para temperaturas de 20 a 300 K y el efecto túnel para 3 de las 5 reacciones propuestas, calculando energías de activación de 21.778 kcal/mol para la reacción 1: c-C3H2 + O2 - C3H2O + O y constantes de velocidad para la reacción 4 CH4 + OH 3 + H2O de 2.3 -C3H2 + OH -C3HOH + H se calcularon tres estados de transición que llevan al isómero cresultados expuestos consistentes con estudios experimentales y teóricos de los sistemas estudiados.
URI: https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/12176
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