https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/63 Wed, 04 Nov 2026 19:56:27 GMT 2026-11-04T19:56:27Z https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/11969 Título : Diseño y evaluación in silico de nuevos derivados del pirrol BM212 como inhibidores de la proteína MmpL3. Autor : Parales Gutiérrez, Yiseth Xiomara. Resumen : One of the biggest challenges in the search for new bioactive compounds against Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is the presence of a strong hydrophobic barrier that prevents the penetration of drugs through the cell wall, causing the appearance of drug resistance. Drug-resistant strains continue to drive scientific research in the search for mechanisms to control this disease, evidencing a clear need to discover new drugs and drug targets to treat these difficult-to-control bacterial infections. (Bolla, J., 2020; Rayasam, G., 2014). On the other hand, considering that the MmpL3 protein is responsible for the biogenesis of the mycobacterial cell wall and the transport of trehalose monomycolate (TMM) which is a structural unit of this cell wall. Given this function, MmpL3 is considered as a potential therapeutic target and has been the focus of many ongoing research efforts, since its inhibition blocks the passage of TMM through the inner membrane, weakening the cell wall of mycobacteria causing the cell death. (Bhakhar et al., 2021; Shao et al., 2020; Munnaluri et al., 2019). In the search for MmpL3 inhibitors, different structures with promising activity against this molecular target have been found. Among these compounds, pyrrole BM212 stands out; a potent inhibitor against multiresistant Mtb strains and one of the most promising compounds against this molecular target, which constitutes a suitable base structure for an optimization process. (Poce et al., 2019; Gaikwad et al., 2021; Wavhale et al., 2017). The purpose of our research work was to identify the substitution pattern crucial to enhance the antimycobacterial activity of the lead molecule BM212. To this end, using an in-silico approach, the BM212 scaffold was systematically explored by making modifications at the N1, C3 and C5 positions of pyrrole, followed by ADME property assessments, molecular/dynamic learning in order to understand the structure relationships. -activity (SAR) of said molecule. In this way, the key parameters to improve the potential activity of the ligands were identified; According to the evaluations of concentration and molecular dynamics, a new series of compounds with better affinity for the MmpL3 binding site will be improved and, in turn, possible candidates for drugs as a synergistic treatment to the current therapeutic procedures for tuberculosis. Descripción : Uno de los mayores retos en la búsqueda de nuevos compuestos bioactivos contra Mycobacterium tuberculosis (Mtb) es la presencia de una fuerte barrera hidrófoba que impide la penetración de fármacos a través de la pared celular, provocando la aparición de resistencia a los medicamentos. Las cepas resistentes a los medicamentos siguen impulsando a la investigación científica en la búsqueda de mecanismos para controlar esta enfermedad, evidenciando una clara necesidad de descubrir nuevos fármacos y dianas farmacológicas para tratar estas infecciones bacterianas difíciles de controlar. (Bolla, J., 2020; Rayasam, G., 2014). Por otra parte, considerando que la proteína MmpL3 es responsable de la biogénesis de la pared celular micobacteriana y del transporte de monomicolato de trehalosa (TMM) el cual es una unidad estructural de esta pared celular. Dada esta función, MmpL3 es considerada como un objetivo terapéutico potencial y ha sido el foco de muchos esfuerzos de investigación en curso, ya que su inhibición bloquea el paso de TMM a través de la membrana interna, debilitando la pared celular de las micobacterias provocando la muerte celular. (Bhakhar et al.,2021; Shao et al., 2020; Munnaluri et al., 2019). En la búsqueda de inhibidores de MmpL3 se han reportado diferentes estructuras con actividad prometedora contra este blanco molecular, dentro de estos compuestos, sobresalen el pirrol BM212; un potente inhibidor frente a cepas de Mtb multirresistentes y uno de los compuestos más prometedores contra este blanco molecular, el cual constituye una estructura base adecuada para un proceso de optimización. (Poce et al., 2019; Gaikwad et al., 2021; Wavhale et al., 2017). El propósito de nuestro trabajo de investigación fue identificar el patrón de sustitución crucial para mejorar la actividad antimicobacteriana de la molécula líder BM212. Para ello, mediante un enfoque in-silico, el andamio de BM212 se exploró sistemáticamente realizando modificaciones en las posiciones N1, C3 y C5 del pirrol, seguidamente de evaluaciones de las propiedades ADME, acoplamiento molecular/dinámica con el fin de comprender las relaciones estructura-actividad (SAR) de dicha molécula. De este modo, se identificaron los parámetros clave para mejorar la actividad potencial de los ligandos; de acuerdo a las evaluaciones de acoplamiento y dinámica molecular se logró proponer una nueva serie de compuestos con mejor afinidad hacía el sitio de unión de MmpL3 y a su vez, potenciales candidatos a fármacos como tratamiento sinérgico a los procedimientos terapéuticos actuales de la tuberculosis. Sun, 01 Jan 2023 00:00:00 GMT https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/11969 2023-01-01T00:00:00Z https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/11963 Título : Seguimiento de volumetría, índice de deterioro a la blanqueabilidad (DOBI) y ácidos grasos libres (AGL) en el control de calidad de aceite de palma crudo (APC) en la planta extractora la Gloria S.A.S. Autor : Serrano Ochoa, Camilo Andrés. Resumen : The study focused on analyzing the quality of palm oil through two main parameters: the percentage of free fatty acids (%AGL) and the bleachability deterioration index (DOBI) at different stages of the process. Where some main values were found as the study of the fresh fruit, where an increase of 0.49% per day in FFA and DOBI decreasing on average of 0.27 units per day was observed. The best results were obtained in the first three days of fruit storage. Another factor was the analysis of the process streams, where the highest oil recoveries were obtained in digester liquor and press, higher than 60% oil. The critical quality points were in the sterilization condensates and rachis press, yielding poor DOBI and high acidity. The best DOBI was found in the digester liquor, due to the controlled treatment of temperature and maceration. Both digester, presses and centrifuges performed well in the quality parameters. Descripción : El estudio se centró en analizar la calidad del aceite de palma mediante dos parámetros principales: el porcentaje de ácidos grasos libres (%AGL) y el índice de deterioro de la blanqueabilidad (DOBI) en diferentes etapas del proceso. Donde se encontraron unos valores principales como el estudio del fruto fresco, donde se observó un incremento del 0.49% por día en AGL y el DOBI disminuyendo en promedio de 0.27 unidades por día. Los mejores resultados se obtuvieron en los primeros tres días de almacenamiento de fruto. Otro factor fue el análisis de las corrientes de proceso, donde las mayores recuperaciones de aceite se obtuvieron en licor de digestores y prensa, mayor a un 60% de aceite. Los puntos críticos de calidad estuvieron en los condensados de esterilización y prensa raquis, arrojando datos de DOBI deficiente, y acidez alta. El mejor DOBI se encontró en el licor del digestor, debido al tratamiento controlado de temperatura y macerado. Tanto digestor, prensas y centrifugas tuvieron un rendimiento bueno en los parámetros de calidad. Mon, 01 Jan 2024 00:00:00 GMT https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/11963 2024-01-01T00:00:00Z https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/10415 Título : Evaluación in silico de la capacidad de captura de CO2 en liquidos ionicos derivados de aminoacidos. Autor : Cruces Velazco, Nayely Melissa. Resumen : The progressive increase in greenhouse gas (GHG) emissions, especially carbon dioxide CO2 and its retention in the atmosphere, has made them the main cause of the increase in the earth's surface temperatures, an effect known as climate change1 . Ionic liquids, defined as salts with a melting temperature below 100 °C, have been studied as promising candidates for CO2 capture and conversion, thanks to their particular properties acquired from their ion composition. In this investigation, a series of 5 choline/amino acid-based ionic liquids were evaluated as CO2 capture agents employing the DFT method at the B3LYP/6-311++G(d,p) computational level in Gaussian Software and its graphical interface GaussView. Interaction energies, HOMO and LUMO frontier molecular orbitals and structural parameters were analyzed in the dipole-dipole interactions of ionic liquids and the induced dipole-dipole interactions of the [LI+CO2] complex. The research was carried out in the energy, chemical transformation and environment group (IBEAR), which in one of its lines of research has been evaluating the capacity to capture GHGs in ionic liquids2 . Descripción : El aumento progresivo de emisiones de gases de efecto invernadero (GEIs) en especial de dióxido de carbono CO2 y su retención en la atmosfera, los ha convertido en los principales responsables del incremento de las temperaturas en la superficie de la tierra, efecto conocido como cambio climático1 . Los líquidos iónicos definidos como sales con una temperatura de fusión inferior a 100°C, han sido estudiados como candidatos prometedores en la captura y conversión de CO2, gracias a sus particulares propiedades adquiridas de su composición de iones. En esta investigación se evaluó una serie de 5 líquidos iónicos a base de colina/aminoácido como agentes de captura de CO2 empleando el método DFT en el nivel de cálculo B3LYP/6-311++G(d,p) en el Software Gaussian y su interfase gráfica GaussView. Se analizaron energías de interacción, orbitales moleculares frontera HOMO y LUMO y parámetros estructurales, en las interacciones dipolo-dipolo de los líquidos iónicos y las interacciones dipolo-dipolo inducido del complejo [LI+CO2]. La investigación se realizó en el grupo de energía transformación química y medio ambiente (IBEAR), el cual en una de sus líneas de investigación, viene evaluando la capacidad de captura de GEIs en líquidos iónicos2 . Sun, 01 Jan 2023 00:00:00 GMT https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/10415 2023-01-01T00:00:00Z https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/10413 Título : Diseño de un biocarbón tipo BOCASHI a partir de pericarpio de Café Castillo. Autor : Lozano Vera, Maria Alejandra. Resumen : In this research, the pericarp, which is a post-harvest residue of coffee, rich in lignin and hemicellulose, compounds that make it usable as a structural support for porous materials, was improved. This allowed the development of a pyrolytic system to obtain biocarbons, which mixed with alkaline oxides, such as calcium oxide (CaO), contributed to the generation of a bokashi, which is characterized by its good retention of organic matter and nutrients. increases soil permeability, reduces greenhouse gas emissions, improves soil porosity, and increases microbial diversity, preventing diseases. The obtained bokashi was characterized by Fourier transform infrared spectroscopy (ATR-FTIR), thermogravimetric analysis (TGA), gas chromatography (GC) volatiles, physicochemical properties and total percentage of nitrogen, establishing that a stable material was obtained with a carbon graphite type, with nitrogen concentrations of 15 to 20% and good phosphorus content. With these results, the bokashi were applied to radish (Raphanus sativus) plants, monitoring the stem, leaf, and root length, establishing that the synthesized materials are appropriate to increase the growth of the studied plants. Descripción : En esta investigación se utilizó el pericarpio que es un residuo poscosecha de café, rico en lignina y hemicelulosa, compuestos que lo hace aprovechable como soporte estructural de materiales porosos. Lo anterior, permitió el desarrollo de un sistema pirolítico para obtener biocarbones, que mezclados con óxidos alcalinos, como el óxido de calcio (CaO) contribuyeron a la generación de un bocashi, que se caracteriza por su buena retención de materia orgánica y de nutrientes, aumenta la permeabilidad del suelo, reduce las emisiones de gases de efecto invernadero, mejora la porosidad del suelo, y aumenta la diversidad microbiana previniendo enfermedades. El bocashi obtenido se caracterizó por espectroscopía infrarroja por transformada de Fourier (ATR-FTIR), análisis termogravimétrico (TGA), los volátiles por cromatografía de gases (GC), propiedades fisicoquímicas y porcentaje total de nitrógeno, logrando establecer que se obtuvo un material estable, de tipo carbono grafito, con concentraciones de nitrógeno del 1,5 al 2,0% y buenos contenidos de fósforo. Con estos resultados, los bocashi se aplicaron sobre plantas de rábano (Raphanus sativus) realizando seguimiento al tallo, hoja y largo de raíz, logrando establecer que los materiales sintetizados son apropiados para aumentar el crecimiento de las plantas estudiadas. Sun, 01 Jan 2023 00:00:00 GMT https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/10413 2023-01-01T00:00:00Z