DSpace Comunidad :https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/52026-06-25T20:00:45Z2026-06-25T20:00:45ZEvaluación in silico de la capacidad de captura de CO2 en liquidos ionicos derivados de aminoacidos.Cruces Velazco, Nayely Melissa.https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/104152025-10-15T23:33:46Z2023-01-01T00:00:00ZTítulo : Evaluación in silico de la capacidad de captura de CO2 en liquidos ionicos derivados de aminoacidos.
Autor : Cruces Velazco, Nayely Melissa.
Resumen : The progressive increase in greenhouse gas (GHG) emissions, especially carbon dioxide CO2
and its retention in the atmosphere, has made them the main cause of the increase in the
earth's surface temperatures, an effect known as climate change1
. Ionic liquids, defined as
salts with a melting temperature below 100 °C, have been studied as promising candidates
for CO2 capture and conversion, thanks to their particular properties acquired from their ion
composition. In this investigation, a series of 5 choline/amino acid-based ionic liquids were
evaluated as CO2 capture agents employing the DFT method at the B3LYP/6-311++G(d,p)
computational level in Gaussian Software and its graphical interface GaussView. Interaction
energies, HOMO and LUMO frontier molecular orbitals and structural parameters were
analyzed in the dipole-dipole interactions of ionic liquids and the induced dipole-dipole
interactions of the [LI+CO2] complex.
The research was carried out in the energy, chemical transformation and environment group
(IBEAR), which in one of its lines of research has been evaluating the capacity to capture
GHGs in ionic liquids2
.
Descripción : El aumento progresivo de emisiones de gases de efecto invernadero (GEIs) en especial de
dióxido de carbono CO2 y su retención en la atmosfera, los ha convertido en los principales
responsables del incremento de las temperaturas en la superficie de la tierra, efecto conocido
como cambio climático1
. Los líquidos iónicos definidos como sales con una temperatura de
fusión inferior a 100°C, han sido estudiados como candidatos prometedores en la captura y
conversión de CO2, gracias a sus particulares propiedades adquiridas de su composición de
iones. En esta investigación se evaluó una serie de 5 líquidos iónicos a base de
colina/aminoácido como agentes de captura de CO2 empleando el método DFT en el nivel
de cálculo B3LYP/6-311++G(d,p) en el Software Gaussian y su interfase gráfica GaussView.
Se analizaron energías de interacción, orbitales moleculares frontera HOMO y LUMO y
parámetros estructurales, en las interacciones dipolo-dipolo de los líquidos iónicos y las
interacciones dipolo-dipolo inducido del complejo [LI+CO2].
La investigación se realizó en el grupo de energía transformación química y medio ambiente
(IBEAR), el cual en una de sus líneas de investigación, viene evaluando la capacidad de
captura de GEIs en líquidos iónicos2
.2023-01-01T00:00:00ZDiseño de un biocarbón tipo BOCASHI a partir de pericarpio de Café Castillo.Lozano Vera, Maria Alejandra.https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/104132025-10-15T22:48:37Z2023-01-01T00:00:00ZTítulo : Diseño de un biocarbón tipo BOCASHI a partir de pericarpio de Café Castillo.
Autor : Lozano Vera, Maria Alejandra.
Resumen : In this research, the pericarp, which is a post-harvest residue of coffee, rich in lignin
and hemicellulose, compounds that make it usable as a structural support for porous
materials, was improved. This allowed the development of a pyrolytic system to obtain
biocarbons, which mixed with alkaline oxides, such as calcium oxide (CaO), contributed
to the generation of a bokashi, which is characterized by its good retention of organic
matter and nutrients. increases soil permeability, reduces greenhouse gas emissions,
improves soil porosity, and increases microbial diversity, preventing diseases.
The obtained bokashi was characterized by Fourier transform infrared
spectroscopy (ATR-FTIR), thermogravimetric analysis (TGA), gas chromatography (GC)
volatiles, physicochemical properties and total percentage of nitrogen, establishing that a
stable material was obtained with a carbon graphite type, with nitrogen concentrations of
15 to 20% and good phosphorus content. With these results, the bokashi were applied to
radish (Raphanus sativus) plants, monitoring the stem, leaf, and root length, establishing
that the synthesized materials are appropriate to increase the growth of the studied plants.
Descripción : En esta investigación se utilizó el pericarpio que es un residuo poscosecha de café,
rico en lignina y hemicelulosa, compuestos que lo hace aprovechable como soporte
estructural de materiales porosos. Lo anterior, permitió el desarrollo de un sistema
pirolítico para obtener biocarbones, que mezclados con óxidos alcalinos, como el óxido
de calcio (CaO) contribuyeron a la generación de un bocashi, que se caracteriza por su
buena retención de materia orgánica y de nutrientes, aumenta la permeabilidad del suelo,
reduce las emisiones de gases de efecto invernadero, mejora la porosidad del suelo, y
aumenta la diversidad microbiana previniendo enfermedades.
El bocashi obtenido se caracterizó por espectroscopía infrarroja por transformada
de Fourier (ATR-FTIR), análisis termogravimétrico (TGA), los volátiles por cromatografía
de gases (GC), propiedades fisicoquímicas y porcentaje total de nitrógeno, logrando
establecer que se obtuvo un material estable, de tipo carbono grafito, con
concentraciones de nitrógeno del 1,5 al 2,0% y buenos contenidos de fósforo. Con estos
resultados, los bocashi se aplicaron sobre plantas de rábano (Raphanus sativus)
realizando seguimiento al tallo, hoja y largo de raíz, logrando establecer que los
materiales sintetizados son apropiados para aumentar el crecimiento de las plantas
estudiadas.2023-01-01T00:00:00ZEvaluación in silico de la interacción del MENTOL en líquidos iónicos derivados de colina y aminoácidos.Triana Suárez, Kerly Del carmen.https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/104112025-10-15T21:51:55Z2023-01-01T00:00:00ZTítulo : Evaluación in silico de la interacción del MENTOL en líquidos iónicos derivados de colina y aminoácidos.
Autor : Triana Suárez, Kerly Del carmen.
Resumen : Ionic liquids (ILs) consist of ions, encompassing organic cations and organic or inorganic
anions. ILs are distinguished by their low volatility, elevated thermal stability, and tunable
molecular structures. These attributes confer upon ILs the potential to supplant conventional
solvents in numerous application domains. In this investigation, a computational, in silico
evaluation was undertaken to scrutinize the interactions of the [AALIs + menthol] complexes
utilizing choline glycinate, choline prolinat, choline sarcosinate, and choline phenylalaninate.
The primary objective was to discern whether these AALIs represent ecologically benign
alternatives to traditional solvents in the context of menthol extraction processes.
The computational analyses were conducted with Gaussian 09 software, in conjunction with
its GaussView visualization tool, employing the Density Functional Theory (DFT) method
at the B3LYP/6-311++G (d, p) level of theory. The computed properties encompassed
optimization and interaction energies, particularly of the dipole-dipole van der Waals type,
molecular orbital energies (HOMO and LUMO), ΔEGap energy, molecular electrostatic
potential (MEP) maps, and various structural parameters including bond angles and lengths.
The outcomes of this study unequivocally affirmed the capacity of all four complexes to
engage in interactions with the menthol molecule.
Descripción : Los líquidos iónicos (LIs) están compuestos por iones: cationes orgánicos y aniones
orgánicos o inorgánicos. Los LIs presentan baja volatilidad, alta estabilidad térmica y
estructuras ajustables, estas características hacen que los LIs tengan la capacidad de sustituir
a los solventes tradicionales en muchos campos. En el presente trabajo, se realizó una
evaluación in silico de las interacciones de los complejos [AALIs + mentol] empleando
glicinato de colina, prolinato de colina, sarcosinato de colina, y fenilalaninato de colina, con
la finalidad de evaluar si estos AALIs son una alternativa ecológica a los solventes
convencionales en procesos de extracción del mentol.
Para llevar a cabo esta investigación se empleó el software Gaussian 09 y su visualizador
GaussView ejecutando el método teórico DFT en el nivel de cálculo B3LYP/6-311++G (d,
p), calculando y analizando las energías de optimización e interacción (fuerza de van der
Waals tipo dipolo – dipolo), orbitales moleculares fronteras (HOMO y LUMO), energía
ΔEGap, mapas de potenciales electrostáticos moleculares (MEP) y parámetros estructurales
(ángulo y longitud). Como resultado se estableció que los cuatro complejos tuvieron la
capacidad de interacción con la molécula de mentol.2023-01-01T00:00:00ZIdentificación de inhibidores selectivos de la CICLOOXIGENASA 2 mediante técnicas in silico.Restrepo Vasquez, Juan Camilo.https://repositoriodspace.unipamplona.edu.co/jspui/handle/20.500.12744/104092025-10-15T21:09:04Z2023-01-01T00:00:00ZTítulo : Identificación de inhibidores selectivos de la CICLOOXIGENASA 2 mediante técnicas in silico.
Autor : Restrepo Vasquez, Juan Camilo.
Resumen : El autor no proporciona la información sobre este ítem.
Descripción : Procesos inflamatorios llevados a cabo durante la progresión de patologías como
la artritis, osteoartritis, hiperplasia prostática, cáncer, entre otras, se han vinculado con la
sobreexpresión de enzimas como la ciclooxigenasa 2 (COX-2), la cual coexiste como una de
las isoformas de la ciclooxigenasa (COX), siendo la COX-1 y COX-2 las principales
isoformas de la COX. La inhibición de la isoforma COX-1 debida al uso de antiinflamatorios
no esteroideos (AINS) conlleva a daños gastrointestinales y renales, por lo que se hace
necesario el uso de AINS selectivos hacia la COX-2. En la actualidad, el único inhibidor
selectivo (celecoxib) de la COX-2 aprobado por la FDA incrementa el riesgo de sufrir
accidentes cerebrovasculares y cardiovasculares. Debido a esto, en este trabajo se buscó
identificar posibles inhibidores selectivos de la COX-2 que pudieran llegar a presentar
efectos antiinflamatorios con menos efectos secundarios. Para esto, se evaluaron 5000
metabolitos de plantas mediante virtual screening a través de un modelo farmacofórico,
docking molecular, energía libre de enlace (EL) y dinámica molecular empleando el software
Maestro de Schrödinger, LLC. Como resultado se logró identificar los metabolitos crisina
(DS:-9,017; EL:-45,68 kcal/mol), apigenina (DS:-10,483; EL:-45,17 kcal/mol), galangina
(DS:-9,943; EL:-53,52 kcal/mol) y 5,7- dihidroxi-3-isoprenil flavona (DS:-10,466; EL:-
75,03 kcal/mol) como posibles inhibidores, los cuales presentaron interacciones
hidrofóbicas, π-π y puentes de hidrógeno con los residuos aminoacídicos Val523, Ser530, y
Tyr385, fundamentales en la inhibición selectiva de la COX-2 ya que permiten la
diferenciación de la COX-2 y metabolización del sustrato natural. Posteriormente, se evaluó
la estabilidad de las poses predichas por los ensayos de docking para cada flavona mediante
dinámica molecular, y los resultados obtenidos permitieron plantear como hipótesis que los
sustituyentes alifáticos y no polares ubicados en el carbono 3 (C-3) de las flavonas juegan un
rol fundamental en la selectividad hacia la COX-2, debido a que mejoran la estabilidad de
las flavonas en complejo con la COX-2. Los resultados mostraron que el metabolito 5,7-
dihidroxi-3-isoprenil flavona presentó una frecuencia de interacción tipo hidrofóbica con la
Val523 del 54%, interacción similar a la observada en los compuestos de referencia
(celecoxib=62%; rofecoxib=80%), lo cual nos permite validar la hipótesis planteada dado
que el único metabolito capaz de establecer interacciones similares a los compuestos de
referencia tiene un sustituyente alifático no polar en el C-3. Finalmente, se puedo concluir
que las flavonas crisina, apigenina, galangina, y en especial la 5,7-dihidroxi-3-isoprenil
flavona representa una nueva alternativa en el diseño y desarrollo de nuevos inhibidores
selectivos de la COX-2, con menos efectos secundarios que los demostrados por los fármacos
aprobados por la FDA.2023-01-01T00:00:00Z